Screening Antimicrobial Activity of Actinomycetes Isolated from Raja Ampat, West Papua, Indonesia

Authors

Arif Nurkanto, Department of Biology, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Universitas Indonesia, Depok 16424, Indonesia
Heddy Julistiono, Research Center for Biology, Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia, Bogor 16911, Indonesia
Andria Agusta, Research Center for Biology, Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia, Bogor 16911, Indonesia

Abstract

Penapisan Aktivitas Antimikroba dari Actinomycetes yang Diisolasi dari Raja Ampat, Papua Barat, Indonesia. Dalam rangka pencarian aktivitas antimikroba dari aktinomycetes di Papua, sebanyak seratus isolat Actinomycetes yang berasal dari tanah dan serasah dari beberapa ekosistem di Pulau Batanta dan Salawati, Papua Barat telah diuji. Sebanyak 200 ekstrak dari 100 isolat Actinomycetes telah diperoleh melalui dua tahap ekstraksi. Metabolit non polar diekstraksi menggunakan pelarut etil asetat : metanol (4:1), sedangkan metabolit polar diperoleh dari pemekatan medium menggunakan metode kering beku. Berdasarkan hasil pengujian menggunakan metode difusi agar, sebanyak 43 dari 200 ekstrak (21,5%) memiliki aktivitas antimikroba terhadap bakteri dan khamir (Escherichia coli NBRC 14237, Bacillus subtilis NBRC 3134, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Micrococcus luteus NBRC 1367, Candida albicans NBRC 1594, dan Saccharomyces cerevisiae NBRC 10217). Hasil penelitian menunjukkan beberapa ekstrak Actinomycetes memiliki aktivitas anti bakteri gram negatif (1,5%), anti bakteri gram positif (17%), dan anti fungi (17%). Metabolit yang diekstraksi dengan pelarut etil asetat : metanol lebih aktif (35%) dibandingkan dengan pelarut air (17%). Sebanyak lima isolat yang memiliki aktivitas antimikroba tertinggi (BL-13-5, BL-06-5, BL-14-2, BL-22-3, dan Sl-36-1) diidentifikasi berdasarkan data sekuen gen 16S rRNA. Berdasarkan hasil pencarian homologi dengan program BLAST, diperoleh homologi spesies berturut-turut adalah Streptomyces kanamyceticus (92%), Streptomyces verne (92%), Streptomyces narbonensis (92%), Streptomyces malachitofuscus (98%), dan Streptomyces hygroscopicus (96%).

References

[1] M.G. Watve, R. Tickoo, M.M. Jog, B.D. Bhole, Arch. Microbiol. 176 (2001) 386. [2] D. Thakur, A. Yadav, B.K. Gogoi, T.C. Bora, J. de Mycolo. Médical. 17 (2007) 242. [3] A.L. Demain, J. Biotechnol. 18 (2000) 499. [4] M. Elibot, J. Proc. Biochem. 39 (2004) 1057. [5] Conservation International, Atlas Sumberdaya Pesisir Kabupaten Raja Ampat, Provinsi Irian Jaya Barat, CI, Jakarta, 2006. [6] S. Mangubhai, http://www.reefresilience.org/ Toolkit_Coral/C8_RajaAmpat.html, 2011. [7] A. Nurkanto, J. Tanah Trop. 14 (2009) 239. [8] N. Rispail, R. Nash, K.J. Webb, J. Lot. Javon. (2005) 341. [9] R.Y. Wu, J. Bot. Bull. Acad. Sin. 25 (1984) 111. [10] A. Isnansetyo, Y. Kamei, J. Anti Age. Chemother. 47 (2003) 480. [11] R.Y. Wu, Acad Sin. 25 (1984) 111. [12] A. Hiraishi, Y. Kamagata, K. Nakamura, J Ferment. Bioeng. 79 (1995) 523. [13] T.A. Hall, Nucl. Acids Symp. Ser. 41 (1999) 95. [14] N. Saitou, M. Nei, J. Mol. Biol. Evol. 4 (1987) 406. [15] J. Felsenstein, J. Org. Evol. 39 (1985) 783. [16] J.D. Thompson, T.J. Gibson, F. Plewniak, D.G. Higgins, J. Nucleic Acids Res. 25 (1997) 4876. [17] J.B. Patel, R.J. Wallace Jr., B.A. Brown-Elliott, T. Taylor, C. Imperatrice, D.B.G. Leonard, R.W. Wilson, L. Mann, K.C. Jost, I. Nachamkin, J. Clin. Microbiol. 42 (2004) 2530. [18] T. Nalina, Z.H.A. Rahim, J. Biotechnol. Biochem. 3 (2007) 10. [19] A.B. Caburian, M.O. Osi, J. Int. Sci. Res. 2 (2010) 2. [20] J.T. Coombs, C.M.M. Franco, J. Appl. Environ. Microbiol. 69 (2003) 5603. [21] J.A. Khan, N. Kumar, J. Phar. Biomed. Sci. 11 (2011) 1. [22] L.P. Garrold, J. Chur. Livingston (1981) 131. [23] S. Pestka, Methods Enzymol. 30 (1975) 261. [24] M. Misumi, N. Tanaka, J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 92 (1980) 647. [25] I. Eiki, H. Gushima, T. Saito, H. Ishida, Y. Oka, T. Osono, J. Ferm. Tech. 66 (1988) 559. [26] T. Tenson, M. Lovmar, M. Ehrenberg, J. Mol. Biol. 330 (2003) 1005. [27] I. Sajid, K.A. Shaaban, S. Hasnain, Brazilian J. Microbiol. 42 (2011) 592. [28] I. Sajid, C.B. Fotso F. Yao, K.A. Shaaban, H. Laatsch, J. Microb. Biotech. 25 (2009) 6001. [29] W. He, L. Wu, Q. Gao, Y. Du, Y. Wang, J. Current Microbiol. 52 (2006) 197 [30] G. Davies, J. Davies, J. Gene 25 (1983) 179. [31] S.N. Graven, O.S. Estrada, H.A. Lardy, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 56 (1966) 654. [32] H. Li, H. Su, S.B. Kim, Y.K. Chang, S. Hong, Y.G. Seo, C.J. Kim, J. Biosci. Bioeng. (2011) in press. [33] C. Sanchez, C. Mendez, J.A. Salas, Nat. Prod. Rep. 23 (2006) 1007.

Recommended Citation

Nurkanto, Arif; Julistiono, Heddy; and Agusta, Andria (2012) "Screening Antimicrobial Activity of Actinomycetes Isolated from Raja Ampat, West Papua, Indonesia," Makara Journal of Science: Vol. 16: Iss. 1, Article 4.
DOI: 10.7454/mss.v16i1.1276
Available at: https://scholarhub.ui.ac.id/science/vol16/iss1/4