•  
  •  
 

Abstract

Since Taq polymerase was first explored and identified from thermophilic bacteria, these bacteria have become well-known sources of thermostable enzymes. New thermophilic bacteria have been investigated to broaden biodiversity and translation research. Studies have shown interests in Indonesia because of thermophilic bacteria found in hot springs. This country is traversed by the ring of fire and has more than 70 volcanoes, resulting in the wide distribution of hot springs across the country. Although many reports have been performed, studies have yet to explore thermophilic bacteria in Tirta Lebak Buana hot springs, Java Island, Indonesia. This research was the first to examine thermophilic bacteria in Tirta Lebak Buana hot spring. Two samples from two different sampling sites were obtained and analyzed through 16srRNA analysis (sampling sites A and B). Measurements indicated that the temperature (50 °C) in sampling site A was higher than that in sampling site B (40 °C), but they had similar pH (7.0). Polymerase chain reaction (PCR) showed that the 16srRNA of the specimen was around 1465 bp. The analysis of the 16srRNA sequence revealed that the obtained bacteria have a similar sequence and close relationship with Bacillus subtilis subsp. stercoris strain N12.

Bahasa Abstract

Identifikasi Bakteri Termofilik Berasal dari Pemandian Air Panas Tirta Lebak Buana, Serang, Banten, Indonesia. Sejak eksplorasi Taq polimerase dari bakteri termofilik, bakteri tersebut menjadi sumber dari enzim yang termostabil. Sebagai hasilnya, banyak sekali eksplorasi untuk mencari bakteri termofilik baru untuk memperluas biodiversitas dan riset aplikasi. Indonesia termasuk salah satu negara yang dikelilingi oleh cincin api sehingga memiliki lebih dari 70 gunung api yang tersebar di seluruh penjuru negeri. Oleh karena itu, Indonesia menjadi negara untuk dijadikan tempat mengkesplorai bakteri termofilik dari pemandian air panas. Meskipun telah banyak laporan yang dihasilkan, belum ada laporan mengenai eksplorasi bakteri termofilik yang berasal dari pemandian Tirta Lebak Buana, Pulau Jawa, Indonesia. Penelitian ini merupakan studi pertama yang dilakukan di tempat tersebut. Dalam penelitian ini, dua sampel didapatkan dari tempat yang berbeda dan dianalisa dengan menggunakan analisis 16srRNA. Dari perhitungan, didapatkan bahwa tempat sumber sampel A memiliki suhu lebih tinggi (50 °C) dibanding tempat sumber sampel B (40 °C). Hasil analisis 16srRNA dengan PCR berhasil dilakukan dengan ukuran sebesar 1465 bp. Analisis dari sekuens 16srRNA menghasilkan bahwa bakteria yang dihasilkan memiliki kemiripan dengan Bacillus subtilis subsp. stercoris strain N12.

References

  1. C.L. Marsh, D.H. Larsen, J. Bacteriol. 65/2 (1953) 193
  2. A. Chien, D.B. Edgar, J.M. Trela, J. Bacteriol. 127/3 (1976) 1550.
  3. P. Hugenholtz, C. Pitulle, K.L. Hershberger, N.R. Pace, J. Bacteriol. 180/2 (1998) 366.
  4. K. Mori, H. Kim, T. Kakegawa, S. Hanada, Extremophiles. 7 (2003) 283.
  5. R.T. Papke, N.B. Ramsing, M.M. Bateson, D.M. Ward, Environ. Microbiol. 5/8 (2003) 650.
  6. B.L. Zamost, H.K. Nielsen, R.L. Starnes, J. Ind. Microbiol. 8 (1991) 71.
  7. P. Manalu, Geothermics. 17/3 (1988) 415.
  8. S. Darma, S. Harsoprayitno, B. Setiawan, A. W Soedibjo, N. Ganefianto, J. Stimac, Geo. Ene. Up. 25 (2010) 29.
  9. G. Huber, R. Huber, B.E. Jones, G. Lauerer, A. Neuner, A. Segerer, K.O. Stetter, E.T. Degens, Syst. Appl. Microbiol. 14/4 (1991) 397.
  10. A.P. Kusumadjaja, T. Budiati, N.N.T. Puspaningsih, S. Sajidan, Ind. J. Chem. 9/3 (2010) 470.
  11. Y. Harnentis, Y. Marlida, M. Rizal, K. Endo Mahata, Pak. J. Nutr. 12/4 (2013) 360.
  12. I. Hafsan, I. Irwan, L. Agustina, A. Natsir, A. Ahmad, Res. J. 5/9 (2017) 16.
  13. S. Ifandi, M. Alwi, Biosaintifika J. Biol. Biol. Ed. 10/2 (2018) 291.
  14. M. Land, L. Hauser, S.-R. Jun, I. Nookaew, M.R. Leuze, T.-H. Ahn, T. Karpinets, O. Lund, G. Kora, T. Wassenaar, S. Poudel, D.W. Ussery, Funct. Integr. Genom. 15/2 (2015) 141.
  15. R. Huber, P. Rossnagel, C.R. Woese, R. Rachel, T.A. Langworthy, K.O. Stetter, Syst. Appl. Microbiol. 19/1 (1996) 40.
  16. D.M. Ward, M.J. Ferris, S.C. Nold, M.M. Bateson, Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62/4 (1998) 1353.
  17. R. Chrisnasari, S. Yasaputera, P. Christianto, V.I. Santoso, T. Pantjajani, J. Math. Fundam. Sci. 48/2 (2016) 149.
  18. A. Yokota, F. Ningsih, D.G. Nurlaili, Y. Sakai, S. Yabe, A. Oetari, I. Santoso, W. Sjamsuridzal, Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66/8 (2016) 3088.
  19. S. Arzita, A. Agustien, Y. Rilda, J. Pure Appl. Microbiol. 11/4 (2017) 1789.
  20. F. Ningsih, A. Yokota, Y. Sakai, K. Nanatani, S. Yabe, A. Oetari, W. Sjamsuridzal, Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69/10 (2019) 3080.
  21. S.-J. Lee, Y.-J. Lee, N. Ryu, S. Park, H. Jeong, S.J. Lee, B.-C. Kim, D.-W. Lee, H.-S. Lee, J. Bacteriol. 194/23 (2012) 6684.
  22. P.A. Eden, T.M. Schmidt, R.P. Blakemore, N.R. Pace, Int. J. Syst. Bacteriol. 41/2 (1991) 324.
  23. H. Jiang, H. Dong, G. Zhang, B. Yu, L.R. Chapman, M.W. Fields, Appl. Environ. Microbiol. 72/6 (2006) 3832.
  24. J. Adelskov, B.K.C. Patel, 3 Biotech 6/1 (2016) 1.
  25. C.M.M.C. Andrade, N. Pereira, G. Antranikian, Rev. Microbiol. 30/4 (1999) 287.
  26. I. Mougiakos, E.F. Bosma, K. Weenink, E. Vossen, K. Goijvaerts, J. Van Der Oost, R. Van Kranenburg, ACS Synth. Biol. 6/5 (2017) 849.
  27. B.T. Mohammad, H.I. Al Daghistani, A. Jaouani, S. Abdel-Latif, C. Kennes, Int. J. Microbiol. 2017 (2017) 1.
  28. A. Kademi, N. Ait-Abdelkader, L. Fakhreddine, J. Baratti, Appl. Microbiol. Biotechnol. 54/2 (2000) 173.

Download

Share

COinS
 
 

To view the content in your browser, please download Adobe Reader or, alternately,
you may Download the file to your hard drive.

NOTE: The latest versions of Adobe Reader do not support viewing PDF files within Firefox on Mac OS and if you are using a modern (Intel) Mac, there is no official plugin for viewing PDF files within the browser window.